非靶向代谢组

非靶向代谢组是指对生物样本中的所有小分子化合物(分子量小于1000)进行定性和定量分析,并比较不同样本间代谢物差异、筛选出在不同组间具有重要生物学意义的显著差异代谢物的技术。由于代谢组受环境变化影响最大,而环境对生物体的影响也最终体现为代谢物的变化,因此代谢组学研究在动植物生长发育、疾病biomarker筛选、药物研发等领域的应用越来越广泛。

应用领域
胁迫应答机理研究
药用植物药用成分合成机理及药物代谢研究
蔬果花卉颜色改良育种
动植物生长发育机理研究
疾病biomarker筛选
疾病发生发展机制研究
药效与毒副作用研究

技术路线

分析内容
1. 标准信息分析

1.1 原始数据预处理(过滤、去冗余、峰识别、峰面积积分、积分校正)
1.2 代谢物鉴定
1.3 代谢物定量
1.4 PCA分析
1.5 (O)PLS-DA分析
1.6 差异代谢物筛选及聚类热图
1.7 差异代谢物KEGG通路富集分析

2. 定制化信息分析
2.1 代谢物调控网络分析
2.2 多组学关联分析(转录组、蛋白组、基因组等,需有相关数据)

样本要求
1. 植物组织:1g鲜重,500mg干重,取样后马上液氮速冻,-80°保存。
2. 植物细胞:107个细胞,取样后离心,去除培养基,液氮速冻,-80°保存。
3. 动物组织:200mg 鲜样,取样后马上液氮速冻至少15min,-80℃保存。
4. 动物细胞:500 万个/例或 107 个细胞;淬灭缓冲液, -80℃甲醇重悬,液氮中速冻至少15min,-80℃保存。
5. 血清:200ul,室温静置离心,取上清低温离心,-80℃保存。
6. 血浆:200ul,肝素钠抗凝管采集全血,室温离心,-80℃保存。
7. 粪便、肠道内容物:200mg鲜样,叠氮化钠处理,立即放入液氮中,速冻至少15min,-80 ℃保存。
8. 尿液:1ml,叠氮化钠处理,-80 ℃保存。
9. 体液、细胞培养液:500ul,液氮速冻,-80°保存。
10. 微生物:108 个细菌或 500mg 菌丝,淬灭试剂淬灭,低温离心,-80℃保存。

项目周期
标准项目的运转周期是60个工作日。

参考文献
Saito K, Matsuda F. Metabolomics for Functional Genomics, Systems Biology, and Biotechnology[J]. Annual Review of Plant Biology, 2010, 61(1): 463-489.
Nakabayashi R, Saito K. Integrated metabolomics for abiotic stress responses in plants[J]. Current Opinion in Plant Biology, 2015: 10-16.